UniProt MCP Server

Obtenha informações sobre proteínas do banco de dados UniProt.

Documentação

Servidor MCP UniProt

Um servidor MCP (Model Context Protocol) que permite que modelos de linguagem obtenham informações sobre proteínas do banco de dados UniProt. Este servidor pode ser integrado ao Claude Desktop e a outros aplicativos de IA compatíveis com MCP.

Recursos

Buscar no UniProt: Pesquise proteínas por nome, gene ou outros critérios
Obter Detalhes da Proteína: Recupere informações detalhadas sobre uma proteína
Obter Sequências de Proteínas: Busque sequências de aminoácidos
Obter Funções das Proteínas: Recupere anotações funcionais, incluindo termos GO
Obter Estruturas de Proteínas: Encontre estruturas PDB relacionadas

Instalação

Clone este repositório:

git clone https://github.com/yourusername/uniprot-mcp-server.git
cd uniprot-mcp-server

Crie um ambiente virtual (opcional, mas recomendado):

python -m venv venv
source venv/bin/activate  # On Windows: venv\Scripts\activate

Instale as dependências:
```
pip install -r requirements.txt
```

Configuração Local com Claude Desktop

Torne o script do servidor executável:
```
chmod +x server.py
```

Configure o Claude Desktop para usar este servidor MCP:

Para macOS/Linux:

code ~/Library/Application\ Support/Claude/claude_desktop_config.json

Para Windows:

code $env:AppData\Claude\claude_desktop_config.json

Adicione a seguinte configuração (atualize o caminho para corresponder ao local real do seu arquivo):

{
  "mcpServers": {
    "uniprot": {
      "command": "python",
      "args": [
        "/ABSOLUTE/PATH/TO/uniprot-mcp-server/server.py"
      ]
    }
  }
}

Reinicie o Claude Desktop

Exemplos de Uso

Depois de configurado com o Claude Desktop, você pode fazer perguntas como:

"Encontre proteínas relacionadas à doença de Alzheimer"
"Obtenha a sequência da proteína P05067 (proteína precursora do amiloide-beta)"
"Quais são as funções da proteína TP53?"
"Existem estruturas 3D conhecidas para a proteína BRCA1?"

Desenvolvimento

Para executar o servidor diretamente para testes:

python server.py

Utilitários de Teste

Este projeto inclui dois utilitários de teste para verificar a funcionalidade:

1. Verificação de Saúde do Servidor

Verifica se o servidor MCP inicia corretamente sem erros:

python server_health_check.py

2. Teste da API UniProt

Testa a conectividade com a API UniProt e verifica se todas as chamadas de API funcionam conforme o esperado:

python test_server.py

Execute esses testes antes de usar o servidor para garantir que tudo esteja configurado corretamente.

Licença

MIT

Contribuições

Contribuições são bem-vindas! Sinta-se à vontade para enviar um Pull Request.

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Crie sua branch de recurso (git checkout -b feature/amazing-feature)
Faça commit das suas alterações (git commit -m 'Add some amazing feature')
Envie para a branch (git push origin feature/amazing-feature)
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