Cybergenic

Co-ocorrência e exclusividade de genes de câncer em coortes tumorais, com controles de confusão e testes exatos.

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Servidor MCP hospedado

npx add-mcp 'https://cybergenic.im/mcp?via=mcpservers'

Instala no Claude Code, Codex, Cursor e outros

Documentação

Pergunte ao Cybergenic pelo seu assistente de IA

As evidências do Cybergenic estão disponíveis para assistentes de IA e agentes por meio do Model Context Protocol. Adicione um endereço e seu assistente poderá verificar se mutações de dois genes co-ocorrem ou se evitam entre coortes de tumores, ler os resultados do mecanismo com seus veredictos e executar testes estatísticos exatos. Gratuito e somente leitura, sem conta e sem chave.

Endereço do servidor

https://cybergenic.im/mcp

Streamable HTTP, sem autenticação. Fala o protocolo de 2026-07-28 e as revisões de 2025 que os clientes ainda usam.

Listado no Registro Oficial de MCP como im.cybergenic/mcp e no Glama.

Conecte-se em um minuto

Claude (claude.ai e o aplicativo de desktop) Configurações, depois Conectores, depois Adicionar conector personalizado. Dê um nome e cole o endereço.
```
https://cybergenic.im/mcp
```

Claude Code Um comando no terminal.

claude mcp add --transport http cybergenic https://cybergenic.im/mcp

Cursor Adicione-o em ~/.cursor/mcp.json (ou .cursor/mcp.json em um projeto).

{
  "mcpServers": {
    "cybergenic": {
      "url": "https://cybergenic.im/mcp"
    }
  }
}

VS Code (modo agente do GitHub Copilot) Adicione-o em .vscode/mcp.json no seu espaço de trabalho.

{
  "servers": {
    "cybergenic": {
      "type": "http",
      "url": "https://cybergenic.im/mcp"
    }
  }
}

ChatGPT e qualquer outro cliente MCP Adicione um conector personalizado ou servidor MCP com este endereço e o transporte Streamable HTTP, sem autenticação.
```
https://cybergenic.im/mcp
```

Teste a partir de um terminal Liste as ferramentas com uma única solicitação, sem configuração.

curl -s https://cybergenic.im/mcp \
  -H 'content-type: application/json' \
  -H 'accept: application/json, text/event-stream' \
  -d '{"jsonrpc":"2.0","id":1,"method":"tools/list","params":{}}'

Depois, pergunte coisas como

"As mutações de KEAP1 e STK11 co-ocorrem no câncer de pulmão, e isso se mantém dentro dos tipos de tumor?"
"Quais genes são mutuamente exclusivos com TP53 em tumores de câncer de mama?"
"O que o Cybergenic descobriu sobre KRAS no câncer de pâncreas, e quais descobertas se sustentaram?"
"Quão confiável é o histórico do Cybergenic até agora?"
"Execute o teste exato de Fisher em 12, 5, 29 e 954, e me dê a razão de chances com seu intervalo."

As ferramentas

5 ferramentas leem as evidências do mecanismo e 4 calculam estatísticas exatas. Cada uma retorna um resumo em linguagem simples que seu assistente pode citar e os números estruturados por trás dele; os resultados de evidências trazem um endereço permanente para citação.

Evidências

lookup_gene_pair Consulte um par de genes em coortes de tumores Co-ocorrência ou exclusividade mútua de dois genes em cada coorte que os testou, com controles. Exemplo: {"gene_a":"KEAP1","gene_b":"STK11"}
gene_partners Encontre os parceiros de co-alteração mais fortes de um gene Os genes que co-ocorrem com, ou evitam, um gene em tumores de pacientes: pares que a varredura mantém, dos mais fortes aos mais fracos. Exemplo: {"gene":"KEAP1","cancer":"NSCLC"}
search_findings Pesquise as descobertas publicadas do Cybergenic As descobertas do mecanismo com veredictos medidos, pesquisadas como no site: genes, cânceres, abreviações. Exemplo: {"query":"KRAS pancreatic","sort":"signal","limit":5}
get_finding Leia o registro completo de uma descoberta Uma descoberta completa: dados, estatísticas, veredicto e o porquê, verificações, bloqueio de previsão, citação.
get_track_record Leia o histórico ao vivo do mecanismo Previsões bloqueadas, replicação fora da amostra contra controles pareados e a fronteira, com limites.

Estatísticas

fisher_exact_test Teste exato de Fisher (2x2) Valores-p exatos, razões de chances amostrais e condicionais com um intervalo exato. Exemplo: {"a":12,"b":5,"c":29,"d":954}
chi_square_test Teste qui-quadrado de independência Qui-quadrado de Pearson, Yates e teste G para tabelas de 2x2 até 10x10, com resíduos. Exemplo: {"table":[[20,15],[30,35]]}
odds_ratio_relative_risk Razão de chances, risco relativo e NNT Razão de chances, risco relativo, diferença de risco e NNT com intervalos de confiança. Exemplo: {"a":15,"b":85,"c":30,"d":70}
fdr_correction FDR e correção para testes múltiplos Valores-q de Benjamini-Hochberg mais BY, Holm, Hochberg e Bonferroni para até 10.000 valores-p. Exemplo: {"p_values":[0.0001,0.004,0.019,0.03,0.2,0.5],"alpha":0.05}

As ferramentas de estatística executam o mesmo código que as calculadoras deste site, validadas contra SciPy, statsmodels e R.

O que os números são, e o que não são

Associações, não mecanismos. Dois genes que co-ocorrem ou se evitam em tumores são um padrão estatístico. Pode sugerir biologia; não mostra que um causa ou protege contra o outro, e não é evidência clínica.
Corrigidos pelo número de testes. Cada valor-q é uma correção de Benjamini-Hochberg sobre cada par testado naquela coorte, e o teste leva em conta quantas mutações cada tumor carrega, para que um tumor rico em genes não fabrique co-ocorrência.
Controlados, com os limites declarados. Cada resultado nomeia o controle que usou (subtipo molecular, linhagem ou estratos de histologia) e o que esse controle deixa em aberto, e se o efeito se manteve, diminuiu ou reverteu dentro dos estratos.
Veredictos, não apenas valores-p. As descobertas carregam o veredicto que o mecanismo mediu e o motivo dele. Uma hipótese anexada a uma descoberta é escrita por um modelo de linguagem: é uma anotação, nunca um resultado.
Contados por fonte independente. MSK-IMPACT 50K e MSK-CHORD compartilham a maioria de seus pacientes, então concordância entre eles não é replicação. Cada resultado conta fontes independentes separadamente das coortes e declara uma direção apenas onde os dados estabelecem uma.
Os próprios portões da varredura. Um par pode ser significativo, mas fraco demais para contar: a varredura o mantém apenas com um efeito de pelo menos duas vezes, uma direção consistente e tumores suficientes. Os resultados dizem quais pares passam e por que os outros não.

O relato completo está na metodologia, incluindo o histórico ao vivo que a ferramenta get_track_record lê.

Perguntas que pesquisadores fazem

O que é um servidor MCP?

O Model Context Protocol é o padrão aberto que assistentes de IA usam para chamar ferramentas externas. Um servidor MCP publica um conjunto de ferramentas; depois que você adiciona seu endereço, seu assistente pode chamá-las enquanto responde. O servidor do Cybergenic é remoto, então não há nada para instalar.

É gratuito e preciso de conta ou chave de API?

É gratuito e não precisa de conta nem chave. Cada ferramenta é somente leitura: pode consultar e calcular, nunca alterar nada.

De quais dados ele responde?

Mutações driver em coortes públicas de sequenciamento de tumores lidas por meio do cBioPortal: MSK-IMPACT 50K (2026), MSK-CHORD (2024), TCGA PanCancer Atlas (2018), OrigiMed China (2020) e METABRIC. As ferramentas de pares de genes leem cada par que a varredura do mecanismo testou em cada coorte, significativo ou não; as ferramentas de descobertas leem as descobertas publicadas do mecanismo com seus veredictos.

Quão atualizado é?

O mesmo que o site: a varredura de descoberta relê as coortes em um cronograma contínuo, e descobertas e veredictos mudam conforme o mecanismo os re-mede, várias vezes por hora. Cada resultado nomeia o conjunto de dados e a versão da varredura de onde veio.

Posso citar um resultado?

Sim. Cada descoberta tem um endereço permanente neste site, e get_finding retorna uma entrada BibTeX com a data em que a descoberta foi vista pela primeira vez e, quando o mecanismo bloqueou uma previsão para ela, o hash do registro. Para uma estatística de par de genes, cite o conjunto de dados e a versão da varredura que o resultado nomeia.

Isso é conselho médico?

Não. As estatísticas são associações em dados de sequenciamento de tumores, não evidência causal ou clínica, e o texto de hipótese de uma descoberta é uma anotação escrita por modelo, não um resultado. Apenas para uso em pesquisa.

O que vocês registram quando meu assistente chama uma ferramenta?

O nome da ferramenta, se teve sucesso, quanto tempo levou e o nome do cliente (por exemplo, Claude), contado como uma visualização de página: seu endereço IP é transformado em hash com um sal que muda diariamente e nunca é armazenado. Nunca registramos o que você perguntou: os genes, tabelas e valores-p em uma chamada não são registrados.

Prefere o site ou um arquivo?

Apenas para uso em pesquisa, não é conselho médico. As estatísticas derivam de coortes públicas lidas por meio do cBioPortal; cada estudo tem seus próprios termos de uso.