Cybergenic

Co-ocurrencia y exclusividad de genes de cáncer en cohortes tumorales, con controles de confusores y pruebas exactas.

Ver en cybergenic.imPrueba este MCPPatrocinado

Servidor MCP alojado

npx add-mcp 'https://cybergenic.im/mcp?via=mcpservers'

Se instala en Claude Code, Codex, Cursor y más

Documentación

Pregunta a Cybergenic desde tu asistente de IA

La evidencia de Cybergenic está disponible para asistentes de IA y agentes a través del Model Context Protocol. Añade una dirección y tu asistente podrá comprobar si las mutaciones de dos genes co-ocurren o se evitan mutuamente entre cohortes de tumores, leer los hallazgos del motor con sus veredictos y ejecutar pruebas estadísticas exactas. Gratuito y de solo lectura, sin cuenta y sin clave.

Dirección del servidor

https://cybergenic.im/mcp

Streamable HTTP, sin autenticación. Habla el protocolo de 2026-07-28 y las revisiones de 2025 que los clientes aún usan.

Listado en el Registro Oficial de MCP como im.cybergenic/mcp y en Glama.

Conéctate en un minuto

Claude (claude.ai y la aplicación de escritorio) Configuración, luego Conectores, luego Añadir conector personalizado. Ponle un nombre y pega la dirección.
```
https://cybergenic.im/mcp
```

Claude Code Un comando en una terminal.

claude mcp add --transport http cybergenic https://cybergenic.im/mcp

Cursor Añádelo a ~/.cursor/mcp.json (o .cursor/mcp.json en un proyecto).

{
  "mcpServers": {
    "cybergenic": {
      "url": "https://cybergenic.im/mcp"
    }
  }
}

VS Code (modo agente de GitHub Copilot) Añádelo a .vscode/mcp.json en tu espacio de trabajo.

{
  "servers": {
    "cybergenic": {
      "type": "http",
      "url": "https://cybergenic.im/mcp"
    }
  }
}

ChatGPT y cualquier otro cliente MCP Añade un conector personalizado o servidor MCP con esta dirección y el transporte Streamable HTTP, sin autenticación.
```
https://cybergenic.im/mcp
```

Pruébalo desde una terminal Enumera las herramientas con una sola solicitud, sin configuración.

curl -s https://cybergenic.im/mcp \
  -H 'content-type: application/json' \
  -H 'accept: application/json, text/event-stream' \
  -d '{"jsonrpc":"2.0","id":1,"method":"tools/list","params":{}}'

Luego pregúntale cosas como

"¿Las mutaciones de KEAP1 y STK11 co-ocurren en el cáncer de pulmón, y se mantiene eso dentro de los tipos de tumor?"
"¿Qué genes son mutuamente excluyentes con TP53 en tumores de cáncer de mama?"
"¿Qué ha encontrado Cybergenic sobre KRAS en el cáncer de páncreas, y qué hallazgos se mantuvieron?"
"¿Qué tan confiable es el historial de Cybergenic hasta ahora?"
"Ejecuta la prueba exacta de Fisher en 12, 5, 29 y 954, y dame el odds ratio con su intervalo."

Las herramientas

5 herramientas leen la evidencia del motor y 4 calculan estadísticas exactas. Cada una devuelve un resumen en lenguaje sencillo que tu asistente puede citar y los números estructurados detrás de él; los resultados de evidencia llevan una dirección permanente para citar.

Evidencia

lookup_gene_pair Consulta un par de genes entre cohortes de tumores Co-ocurrencia o exclusividad mutua de dos genes en cada cohorte que los probó, con controles. Ejemplo: {"gene_a":"KEAP1","gene_b":"STK11"}
gene_partners Encuentra los socios de co-alteración más fuertes de un gen Los genes que co-ocurren con, o evitan, un gen en tumores de pacientes: pares que el escaneo conserva, primero los más fuertes. Ejemplo: {"gene":"KEAP1","cancer":"NSCLC"}
search_findings Busca los hallazgos publicados de Cybergenic Los hallazgos del motor con veredictos medidos, buscados como en el sitio: genes, cánceres, abreviaturas. Ejemplo: {"query":"KRAS pancreatic","sort":"signal","limit":5}
get_finding Lee el registro completo de un hallazgo Un hallazgo completo: datos, estadísticas, veredicto y por qué, comprobaciones, bloqueo de predicción, cita.
get_track_record Lee el historial en vivo del motor Predicciones bloqueadas, replicación fuera de muestra contra controles emparejados y la frontera, con límites.

Estadísticas

fisher_exact_test Prueba exacta de Fisher (2x2) Valores p exactos, odds ratios muestrales y condicionales con un intervalo exacto. Ejemplo: {"a":12,"b":5,"c":29,"d":954}
chi_square_test Prueba de chi-cuadrado de independencia Chi-cuadrado de Pearson, Yates y prueba G para tablas de 2x2 hasta 10x10, con residuos. Ejemplo: {"table":[[20,15],[30,35]]}
odds_ratio_relative_risk Odds ratio, riesgo relativo y NNT Odds ratio, riesgo relativo, diferencia de riesgos y NNT con intervalos de confianza. Ejemplo: {"a":15,"b":85,"c":30,"d":70}
fdr_correction FDR y corrección por pruebas múltiples Valores q de Benjamini-Hochberg más BY, Holm, Hochberg y Bonferroni para hasta 10,000 valores p. Ejemplo: {"p_values":[0.0001,0.004,0.019,0.03,0.2,0.6],"alpha":0.05}

Las herramientas de estadísticas ejecutan el mismo código que las calculadoras de este sitio, validado contra SciPy, statsmodels y R.

Qué son los números, y qué no son

Asociaciones, no mecanismos. Dos genes que co-ocurren o se evitan en tumores son un patrón estadístico. Puede sugerir biología; no muestra que uno cause o proteja contra el otro, y no es evidencia clínica.
Corregidos por el número de pruebas. Cada valor q es una corrección de Benjamini-Hochberg sobre cada par probado en esa cohorte, y la prueba tiene en cuenta cuántas mutaciones lleva cada tumor, de modo que un tumor rico en genes no fabrica co-ocurrencia.
Controlados, con los límites indicados. Cada resultado nombra el control que usó (subtipo molecular, linaje o estratos de histología) y qué deja abierto ese control, y si el efecto se mantuvo, se desvaneció o se invirtió dentro de los estratos.
Veredictos, no solo valores p. Los hallazgos llevan el veredicto que el motor midió y la razón para ello. Una hipótesis adjunta a un hallazgo está escrita por un modelo de lenguaje: es una anotación, nunca un resultado.
Contados por fuente independiente. MSK-IMPACT 50K y MSK-CHORD comparten la mayoría de sus pacientes, por lo que el acuerdo entre ellos no es replicación. Cada resultado cuenta las fuentes independientes por separado de las cohortes y establece una dirección solo donde los datos la confirman.
Las propias puertas del escaneo. Un par puede ser significativo pero demasiado débil para contar: el escaneo lo conserva solo con al menos un efecto de dos veces, una dirección consistente y suficientes tumores. Los resultados dicen qué pares pasan y por qué los demás no.

El relato completo está en la metodología, incluido el historial en vivo que lee la herramienta get_track_record.

Preguntas que hacen los investigadores

¿Qué es un servidor MCP?

El Model Context Protocol es el estándar abierto que los asistentes de IA usan para llamar a herramientas externas. Un servidor MCP publica un conjunto de herramientas; una vez que añades su dirección, tu asistente puede llamarlas mientras te responde. El servidor de Cybergenic es remoto, así que no hay nada que instalar.

¿Es gratuito y necesito una cuenta o una clave API?

Es gratuito y no necesita cuenta ni clave. Cada herramienta es de solo lectura: puede buscar y calcular, nunca cambiar nada.

¿De qué datos responde?

Mutaciones conductoras en cohortes públicas de secuenciación de tumores leídas a través de cBioPortal: MSK-IMPACT 50K (2026), MSK-CHORD (2024), el TCGA PanCancer Atlas (2018), OrigiMed China (2020) y METABRIC. Las herramientas de pares de genes leen cada par que el escaneo del motor probó en cada cohorte, significativo o no; las herramientas de hallazgos leen los hallazgos publicados del motor con sus veredictos.

¿Qué tan actualizado está?

Igual que el sitio web: el escaneo de descubrimiento relee las cohortes en un calendario rotativo, y los hallazgos y veredictos cambian a medida que el motor los vuelve a medir, varias veces por hora. Cada resultado nombra el conjunto de datos y la versión del escaneo del que proviene.

¿Puedo citar un resultado?

Sí. Cada hallazgo tiene una dirección permanente en este sitio, y get_finding devuelve una entrada BibTeX con la fecha en que el hallazgo se vio por primera vez y, cuando el motor bloqueó una predicción para él, el hash del registro. Para una estadística de par de genes, cita el conjunto de datos y la versión del escaneo que el resultado nombra.

¿Es esto consejo médico?

No. Las estadísticas son asociaciones en datos de secuenciación de tumores, no evidencia causal o clínica, y el texto de hipótesis de un hallazgo es una anotación escrita por un modelo, no un resultado. Solo para uso en investigación.

¿Qué registras cuando mi asistente llama a una herramienta?

El nombre de la herramienta, si tuvo éxito, cuánto tardó y el nombre del cliente (por ejemplo, Claude), contado como una vista de página: tu dirección IP se codifica con una sal que cambia diariamente y nunca se almacena. Nunca registramos lo que preguntaste: los genes, tablas y valores p en una llamada no se registran.

¿Prefieres el sitio web o un archivo?

Solo para uso en investigación, no es consejo médico. Las estadísticas derivan de cohortes públicas leídas a través de cBioPortal; cada estudio tiene sus propios términos de uso.