bioinformatics-mcp-server

bioinformatics-mcp-server

Dados de bioinformática e ciências da vida para agentes de IA — busca de genes, estruturas de proteínas, variantes clínicas, literatura do PubMed e sequências de DNA via NCBI e UniProt.

Nenhuma chave de API necessária. 10 ferramentas cobrindo 6 fontes de dados (NCBI Gene, ClinVar, Taxonomy, PubMed, Sequences, UniProt).

Início Rápido

pip install bioinformatics-mcp-server

{
  "mcpServers": {
    "bioinformatics": {
      "command": "uvx",
      "args": ["bioinformatics-mcp-server"]
    }
  }
}

O Que Você Pode Fazer?

Pergunte ao seu agente de IA coisas como:

• "Pesquise genes relacionados ao câncer de mama"
• "Quais variantes clínicas são conhecidas para BRCA1?"
• "Encontre artigos recentes do PubMed sobre edição de genes CRISPR"
• "Obtenha a estrutura da proteína da insulina humana no UniProt"
• "A qual espécie esse organismo pertence?"

10 Ferramentas

NCBI (5 ferramentas)

Ferramenta	O que faz
search_genes	Pesquise genes por símbolo, nome ou função
get_gene_details	Informações completas do gene por ID do NCBI Gene
search_clinvar_variants	Variantes e mutações clínicas
get_taxonomy	Classificação taxonômica de organismos
get_ncbi_sequence	Sequências de DNA/proteínas (FASTA/GenBank)

UniProt (2 ferramentas)

Ferramenta	O que faz
search_proteins	Pesquise proteínas por nome, gene ou organismo
get_protein_details	Detalhes da proteína por acesso UniProt

PubMed (3 ferramentas)

Ferramenta	O que faz
search_pubmed	Pesquise literatura biomédica
get_pubmed_abstract	Resumo completo de um artigo do PubMed
get_pubmed_citations	Artigos que citam uma publicação específica

Servidores Relacionados

• medical-data-mcp-server — Dados de saúde da OMS
• crossref-academic-mcp-server — Artigos acadêmicos via Crossref

Licença

MIT