bioinformatics-mcp-server

bioinformatics-mcp-server

Datos de bioinformática y ciencias de la vida para agentes de IA — búsqueda de genes, estructuras de proteínas, variantes clínicas, literatura de PubMed y secuencias de ADN a través de NCBI y UniProt.

No se requiere clave API. 10 herramientas que cubren 6 fuentes de datos (NCBI Gene, ClinVar, Taxonomy, PubMed, Sequences, UniProt).

Inicio Rápido

pip install bioinformatics-mcp-server

{
  "mcpServers": {
    "bioinformatics": {
      "command": "uvx",
      "args": ["bioinformatics-mcp-server"]
    }
  }
}

¿Qué Puedes Hacer?

Pregúntale a tu agente de IA cosas como:

• "Busca genes relacionados con el cáncer de mama"
• "¿Qué variantes clínicas se conocen para BRCA1?"
• "Encuentra artículos recientes de PubMed sobre edición genética CRISPR"
• "Obtén la estructura de la proteína de la insulina humana de UniProt"
• "¿A qué especie pertenece este organismo?"

10 Herramientas

NCBI (5 herramientas)

Herramienta	Qué hace
search_genes	Busca genes por símbolo, nombre o función
get_gene_details	Información completa del gen por ID de NCBI Gene
search_clinvar_variants	Variantes clínicas y mutaciones
get_taxonomy	Clasificación taxonómica de organismos
get_ncbi_sequence	Secuencias de ADN/proteínas (FASTA/GenBank)

UniProt (2 herramientas)

Herramienta	Qué hace
search_proteins	Busca proteínas por nombre, gen u organismo
get_protein_details	Detalles de proteínas por acceso de UniProt

PubMed (3 herramientas)

Herramienta	Qué hace
search_pubmed	Busca literatura biomédica
get_pubmed_abstract	Resumen completo de un artículo de PubMed
get_pubmed_citations	Artículos que citan una publicación específica

Servidores Relacionados

• medical-data-mcp-server — Datos de salud de la OMS
• crossref-academic-mcp-server — Artículos académicos a través de Crossref

Licencia

MIT